Kay und Nya sind auf der Suche nach ihren Eltern. Sie glauben fest daran, dass die beiden noch am Leben sind und nun für Krux und Acronix arbeiten. Die Meister der Zeit haben in der Zwischenzeit eine weitere Zeitklinge entdeckt, aber die Ninja tun alles, um sie ihnen wieder abzujagen. Doch sie haben nicht mit der "Verhängnisvollen Dämmerung" gerechnet. Einer Zeitmaschine, die Krux und Acronix entgültig ans Ziel ihrer Wünsche bringen soll. Doch wird ihr böser Plan wirklich gelingen?